Construído em 1652, o Convento passou para o Estado em 1834 após a extinção das ordens religiosas. No século XIX, o exército transformou-o em quartel militar, e a igreja foi doada à Ordem Terceira do Carmo. Um sismo em 1926 destruiu parte do convento, restando duas alas do claustro do século XVIII. O exército abandonou o edifício no início do século XX.
Em 2019, o Grupo Lux Mundi apresentou uma candidatura ao programa REVIVA para transformar o convento num hotel de 5 estrelas, mas, após quatro anos, não há novidades sobre este investimento e como as fotos documentam é lamentável.

A falta de investimento afeta também outros projetos na Horta, como o “The Book Hotel” no antigo Grémio Literário Artista Faialense e a recuperação da Casa das Torrinhas.

