A construção remonta ao século XVII, mais especificamente a 1652, sob a influência de D. Helena de Boim, esposa do então Capitão-mor Francisco Gil da Silveira. Com a extinção das ordens religiosas em 1834, o convento foi entregue ao Estado, que em meados do século XIX instalou o exército no convento (que passou a ser quartel militar), tendo a igreja sido doada, pelo Estado, à Ordem Terceira do Carmo (que a detém até hoje).
O sismo de 1926 destruiu parte das estruturas, mas restam duas alas do claustro do final do século XVIII, sendo a única estrutura conventual ainda existente na ilha do Faial, que inclui o antigo refeitório conventual.
O Exército Português ocupou o edifício desde do fins do século XIX até ao inicio do Século XX, quando saiu definitivamente da nossa ilha, deixando o edifício, sob responsabilidade do Estado Português, ao abandono até aos dias de hoje.
Em 2019, surgiu uma solução promissora que trouxe esperança à comunidade faialense. O Grupo Lux Mundi – Empreendimentos Hoteleiros, SA, apresentou uma candidatura ao programa REVIVA para a construção de um hotel de 5 estrelas nas instalações do antigo convento. Passados quatro anos, a degradante situação do edifício permanece sem que haja qualquer discussão ou atividade visível na sociedade faialense sobre o assunto.
É crucial compreender este hiato de tempo ou a, eventual, desistência de investimentos significativos para a cidade da Horta, como são os casos do antigo Grémio Literário Artista Faialense, situado no largo do Bispo, onde se iria instalar o “The Book Hotel”, boutique hotel, que está à venda, ou o investimento de recuperação da Casa das Torrinhas, também esta posta novamente no mercado imobiliário, para além das Termas do Varadouro, que permanecem, teimosamente, à espera de um privado, porque sucessivos Governos Regionais entenderam que no Faial deveria ser diferente das restantes estações termais, onde foi o Governo Regional a intervir.
